历经40多年的发展，现有国家重点学科、211工程重点建设学科和江西省重点学科。在全国第四轮学科评估中, 食品科学与工程学科获评A级学科，位居食品学科全国第三；在第五轮学科评估中,食品科学与工程学科又取得了历史性突破。南昌大学食品学科在“US News 全球大学排名”中位居全球第7位、在“软科世界一流学科排名”中位居全球第8位；截至2025年5月，南昌大学农业科学学科（以食品为主）进入ESI全球排名前0.255‰。这些成绩标志着我院食品学科已经进入国际高水平学科行列，正向世界一流学科稳步前进！

下设食品科学与工程系、食品营养与安全系、食品发酵与生物工程系；设有食品科学与工程、食品质量与安全和生物工程3个本科专业，均入选国家级一流本科专业建设点，且均通过中国工程教育认证；2025年新获批食品营养与健康本科专业。现有食品科学与工程博士后科研流动站，拥有食品科学与工程、生物工程、公共卫生与预防医学（与公卫学院共建）3个一级学科博士学位授权点，生物与医药专业博士学位授权点，食品科学与工程、公共卫生与预防医学、生物工程3个一级学科学术型硕士学位授权点，生物与技术工程、食品工程、发酵工程、食品与营养等专业学位硕士学位授权点（含领域）。已构建食品科学与工程、食品质量与安全、生物工程专业完整的本、硕、博三级学生培养体系。